Farmasotik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
Farmasötik Mikrobiyoloji, insanlarda enfeksiyona neden olan mikroorganizmaların özelliklerini, bu mikroorganizmaların neden olduğu hastalıkları ve bu hastalıkların tanısında kullanılan mikrobiyolojik yöntemleri inceler. Ayrıca antimikrobiyal ajanlar ve mikrobiyal kaynaklı ürünlerin üretimi, kozmetik ve farmasötiklerde mikrobiyolojik kalite kontrol prosedürleri, sterilizasyon-dezenfeksiyon yöntemleri ve genel hijyen gibi konular da Farmasotik Mikrobiyoloji’nin ilgi alanına girer. Anabilim dalımız interdisipliner bir bilim dalı olan Farmasötik Mikrobiyoloji alanındaki temel kavramları özümsemis ve bunları mesleğin her alanında uygulama yeteneğine sahip olan eczacılar, temel bilimciler ve araştırmacılar yetiştirmeyi amaç edinmiştir. Bunun yanı sıra, Anabilim Dalımız, Farmasötik Mikrobiyoloji ve Tıbbi Mikrobiyoloji alanındaki gelişmeleri yakından takip ederek toplum sağlığına hizmet eden güncel araştırmalar yapmayı ve edindiği bilgi birikimini ulusal ve uluslararası platformda öğrencilere, bilim dünyasına, endüstriye ve topluma en etkin şekilde aktarmayı hedeflemektedir.
Anabilim Dalı Olanakları
Anabilim dalımızın, her biri 40 m2’lik 2 laboratuvarı vardır. Bu laboratuarlarda hem klasik Mikrobiyolojik kültür çalışmaları hem de ileri moleküler mikrobiyolojik tanı ve moleküler epidemiyoloji çalışmaları yapmaya uygun teknik ekipman ve çalışma şartları mevcuttur. Araştırma laboratuarımızda antimikrobiyal aktivite çalışmaları, bakteri, mantar, virüs ve parazitlerin nükleik asit amplifikasyon temelli tanı ve ileri tiplendirilmesi için kullanılan PCR, PCR-RFLP, rt-PCR, DNA dizi analizi, ayrıca immünokimyasal tanı ve karakterizasyon amaçlı Westernblot, Dot Blot, ELISA gibi teknikler başarı ile uygulanmaktadır. Ayrıca Anabilim dalımızın öğretim üyeleri Mersin Üniversitesi İleri Teknoloji Eğitim Araştırma ve Uygulama Merkezi (MEITAM) bünyesinde, bir alt yapı projesi ile kurulan, kanserin erken tanısı ileri moleküler tanı laboratuvarının ve bu laboratuvarda yürütülen miRNA tabanlı kanser tanı çalışmalarının proje ortaklarıdır. Bu moleküler tanı laboratuvarında, kurulan nanoteknoloji temelli yüksek kapasiteli Real Time-PCR sistemi, anabilim dalımızca, gerek araştırma amaçlı gerekse eğitim amaçlı olarak öğrencilerimizin kullanımına sunulmaktadır
Son İki Yılda Uluslararası Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2025
40. Oğultekin teneke, S.; Serin, M.; öksüz, Z.; Temel, G.; Yaraş, S.; üçbilek, E.; Sezgin, O. Circulating chemokine levels and receptor polymorphisms have potential as biomarkers for fibrosis stages in patients with chronic hepatitis C infection. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS, 2025, 52, 12-.
10.1007/s11033-025-10244-5
2025
39. Alterkaoui, A.; Gonca, S.; Doğan, S.; ışık, Z.; özdemir, S.; Filiz, V.; Dizge, N. Preparation of Cobalt Oxide Powders Synthesized by Green Chemistry Method and Improving the Antibacterial Performance of PES Membrane. WATER, AIR, & SOIL POLLUTION, 2025, 236, -.
2024
38. Giray, G.; Gonca, S.; özdemir, S.; ışık, Z.; Yılmaz, E.; Soylak, M.; Dizge, N. Novel extracellular synthesized silver nanoparticles using thermophilic Anoxybacillus flavithermus and Geobacillus stearothermophilus and their evaluation as nanodrugs. PREPARATIVE BIOCHEMISTRY & BIOTECHNOLOGY, 2024, 54, 294-306.
37. ülger, M. Design, synthesis, biological evaluation and docking analysis of pyrrolidine-benzenesulfonamides as carbonic anhydrase or acetylcholinesterase inhibitors and antimicrobial agents. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, 2024, 42, 3441-3458.
36. Aktaş, D.; Kaplan, E.; Ergin, .; Ilkit, M.; Döğen, A. Çevresel Örneklerde Cryptococcus Kolonizasyonunun ve Eşey Genotipinin Araştırılması. MIKROBIYOLOJI BÜLTENI, 2024, 58, 39-48.
35. ödemiş, .; özdemir, S.; Gonca, S.; Ağırtaş, M. Characterization of silver nanoparticles fabricated by green synthesis using Urtica dioica and Lavandula angustifolia and investigation of antimicrobial and antioxidant. INORGANIC AND NANO-METAL CHEMISTRY, 2024, 54, 429-442.
34. Koçak, Y.; Aygün, A.; Altuner, E.; özdemir, S.; Gonca, S.; Berikten, D.; Tiri, R.; şen, F. Eco-friendly production of platinum nanoparticles: physicochemical properties, evaluation of biological and catalytic activities. INTERNATIONAL JOURNAL OF ENVIRONMENTAL SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2024, 21, 51-62.
33. Buğa aktekin, M.; öksüz, Z.; Türkmenoğlu, B.; Istifli, E.; Kuzucu, M.; Algül, . Synthesis and evaluation of di‐heterocyclic benzazole compounds as potential antibacterial and anti‐biofilm agents against Staphylococcus aureus. CHEMICAL BIOLOGY & DRUG DESIGN, 2024, 104, -.
32. Tiri, R.; Aygun, A.; Bekmezci, M.; Gonca, S.; özdemir, S.; Kaymak, G.; Karimi‑maleh, H.; şen, F. Environmental Energy Production and Wastewater Treatment Using Synthesized Pd Nanoparticles with Biological and Photocatalytic Activity. TOPICS IN CATALYSIS, 2024, 67, -.
31. Binzet, G.; Turunç, E.; Binzet, R.; Döğen, A.; Arslan, H. Chemical composition and antimicrobial activity of essential oils and various extracts of endemic Onosma malatyana (Boraginaceae) from Anatolia. INTERNATIONAL JOURNAL OF ENVIRONMENTAL HEALTH RESEARCH, 2024, , -.
2023
30. Kaya, H.; Ersoy, L.; ülger, M.; Bozok, T.; Aslan, G. Investigation of efflux pump genes in isoniazid resistant Mycobacterium tuberculosis isolates. INDIAN JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY, 2023, 46, 100428-.
29. öksüz, Z.; Gragnani, L.; Lorini, S.; Temel, G.; Serin, M.; Zignego, A. Evaluation of Plasma miR-17-5p, miR-24-3p and miRNA-223-3p Profile of Hepatitis C Virus-Infected Patients after Treatment with Direct-Acting Antivirals. MDPI AG, 2023, 13, 1188-.
28. Gonca, S.; Polat, B.; özay, Y.; özdemir, S.; Küçükkara, .; Atmaca, H.; Dizge, N. Investigation of diode laser effect on the inactivation of selected Gram-negative bacteria, Gram-positive bacteria and yeast and its disinfection on wastewater and natural milk. ENVIRONMENTAL TECHNOLOGY, 2023, 44, 1238-1250.
27. Saleh, L.; Altıntaş, B.; Filiciotto, L.; Zorlu, Y.; Luque, R.; ülger, M.; Döndaş, H.; Altug, C. Structural assessment of novel spiro-naphthalene-1.2'-[1,3,4]oxadiazol-4-ones prepared under batch and flow chemistry with a concise antifungal and anti(myco)bacterial activity. TETRAHEDRON, 2023, 131, 133231-133231.
26. Poyraz, S.; Dondas, H.; Sansano, J.; Belveren, S.; Yamalı, C.; Ulger, M.; Yaktubay dondas, N.; Saglık, B.; Pask, C. N-Benzoylthiourea-pyrrolidine carboxylic acid derivatives bearing an imidazole moiety: Synthesis, characterization, crystal structure, in vitro ChEs inhibition, and antituberculosis, antibacterial, antifungal studies. JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE, 2023, 1273, 134303-134303.
25. Erdoğan eliuz, E.; Everest, Z.; Serin, M. Antimicrobial activity of Stachys rupestris Montbret et Aucher ex Benth. and inactivation of the pathogens inoculated on lab-made skin by the essential oil. INFORMA UK LIMITED, 2023, 33, 1749-1759.
24. Güzel kara, S.; öksüz, Z.; Uras güngör, .; Belveren, S.; Kahraman, A. Phytochemical analysis and biological activities of Salvia candidissima subsp. candidissima mericarps. BOTANICA SERBICA, 2023, 47, 19-29.
23. Eroglu, P.; Cıvaner, M.; Dogan calhan, S.; Ulger, M.; Bınzet, R. Potential Biochemical Properties of Endemic Onosma mutabilis. ACTA CHIM. SLOV, 2023, 70, 196-203.
22. özgür, D.; Ersoy, L.; ülger, M.; Tezcan ülger, S.; Aslan, G. Birinci Seçenek Antitüberküloz İlaçlara ve Verapamil Kombinasyonuna Maruz Bırakılan Dirençli Mycobacterium tuberculosis Kompleks Klinik İzolatlarındaki Efluks Pompa Genlerinin Araştırılması. MIKROBIYOL BUL, 2023, 57, 207-219.
21. Yalçın özkat, G.; Ersan, R.; ülger, M.; Tezcan ülger, S.; Burmaoğlu, S.; Yıldız, .; Algül, . Design, synthesis, and computational studies of benzimidazole derivatives as new antitubercular agents. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE AND DYNAMICS, 2023, 41, 2667-2686.
20. Harmandar, K.; Gonca, S.; Küçük, T.; Günay, A.; Atilla, D.; özdemir, S.; Gürek, A. Zn(II) phthalocyanines having fluoroether groups: Synthesis, characterization, photo-physicochemical and biological properties. WORLD SCIENTIFIC PUB CO PTE LTD, 2023, 27, 340-349.
19. Yaşar, N.; Tezcan ülger, S.; ülger, M.; Arslantürk, A.; Aslan, G.; Köksal, F. Etambutole Dirençli ve Duyarlı Mycobacterium tuberculosis Kompleksi Klinik İzolatlarında embA, embB ve embC Gen Bölgesi Mutasyonları. MIKROBIYOL BUL, 2023, 57, 45-59.
18. Eskikaya, B.; özdemir, S.; Gonca, S.; Dizge, N.; Balakrishnan, D.; Shaik, F.; Senthilkumar, N. A comparative study of iron nanoflower and nanocube in terms of antibacterial properties. APPLIED NANOSCIENCE, 2023, 13, 5421-5433.
17. Yamalı, C.; Sevin, S.; Nenni, M.; Tuğrak sakarya, M.; Uyar, R.; Aygül, A.; ülger, M.; Ilhan, R.; Levent, S. Design, synthesis, and assessment of pharmacological properties of indole-based fluorinated chalcones and their benzenesulfonamide analogs. CHAMICAL PAPERS, 2023, 77, 7903-7918.
16. Yefimova, S.; Klochkov, V.; Kavok, N.; Tkachenko, A.; Onishchenko, A.; Chumachenko, T.; Dizge, N.; özdemir, S.; Gonca, S. Antimicrobial activity and cytotoxicity study of cerium oxide nanoparticles with two different sizes. WILEY, 2023, 111, 872-880.
15. Poyraz, S.; Döndaş, H.; Sansano, J.; Belveren, S.; Yamalı, C.; ülger, M.; Döndaş, N.; Sağlık, B.; Pask, C. N-Benzoylthiourea-pyrrolidine carboxylic acid derivatives bearing an imidazole moiety: Synthesis, characterization, crystal structure, in vitro ChEs inhibition, and antituberculosis, antibacterial, antifungal studies. JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE, 2023, 1273, -.
14. Saleh, M.; ışık, Z.; Belibagli, P.; Arslan, H.; Gonca, S.; özdemir, S.; Kudaibergenov, N.; Khataee, A.; Dizge, N. Fabrication of Ag nanoparticles coated leonardite basalt ceramic membrane with improved antimicrobial properties for DNA cleavage, E. coli removal and antibiofilm effects. JOURNAL OF INDUSTRIAL AND ENGINEERING CHEMISTRY, 2023, 128, -.
13. Barçın, T.; Haj ersan, R.; Alagöz, M.; Döğen, A.; Burmaoglu, S.; Algül, . Deep learning approach to the discovery of novel bisbenzazole derivatives for antimicrobial effect. ELSEVIER BV, 2023, 1295, -.
12. öksüz, Z.; Gragnani, L.; Lorini, S.; Temel, G.; Serin, M.; Zignego, A. Evaluation of Plasma miR-17-5p, miR-24-3p and miRNA-223-3p Profile of Hepatitis C Virus-Infected Patients after Treatment with Direct-Acting Antivirals. MDPI AG, 2023, 13, -.
11. Saleh, L.; Altıntaş, B.; Filiciotto, L.; Zorlu, Y.; Luque, R.; ülger, M.; Döndaş, H.; Altuğ, C. Structural assessment of novel spiro-naphthalene-1.2- [1,3,4]oxadiazol-4-ones prepared under batch and flow chemistry with a concise antifungal and anti(myco)bacterial activity. TETRAHEDRON, 2023, 131, -.
10. Turabik, M.; özdemir, S.; Akinbingol, G.; Gonca, S.; Geçgel, C. Comparison of antioxidant, antimicrobial, DNA cleavage, cell viability, and biofilm inhibition activities of mono- and bimetallic copper and zinc nanoparticles. ELSEVIER BV, 2023, 155, -.
9. Albayrak, S.; Farajzadeh, N.; Yenilmez, H.; özdemir, S.; Gonca, S.; Altuntaş bayır, Z. Fluorinated Phthalocyanine/Silver Nanoconjugates for Multifunctional Biological Applications. CHEMISTRY & BIODIVERSITY, 2023, 20, -.
8. Karimi, F.; Tiri, R.; Aygun, A.; Gulbagca, F.; özdemir, S.; Gonca, S.; Gür, T.; şen, F. One-step synthesized biogenic nanoparticles using Linum usitatissimum: Application of sun-light photocatalytic, biological activity and electrochemical H2O2 sensor. ELSEVIER BV, 2023, 218, -.
7. ısik, Z.; Bouchareb, R.; Arslan, H.; özdemir, S.; Gonca, S.; Dizge, N.; Balakrishnan, D.; Prasad, S. Green synthesis of iron oxide nanoparticles derived from water and methanol extract of Centaurea solstitialis leaves and tested for antimicrobial activity and dye decolorization capability. ELSEVIER BV, 2023, 219, -.
6. Bouras, H.; Bouras, N.; Alterkaoui, A.; ısik, Z.; Gonca, S.; özdemir, S.; Dizge, N. Biosynthesis of Silver Nanoparticles Using Saccharothrix algeriensis and Preparation of Antifouling PES Membranes. WATER AIR SOIL POLLUT, 2023, 234, -.
5. Turunç, E.; Karaman, O.; Döğen, A.; Binzet, R. Green synthesis of graphene quantum dot- and its electrochemical, antioxidant and antimicrobial activities. ELSEVIER BV, 2023, 299, -.
4. Metin, D.; Hilmioğlu polat, S.; Döğen, A.; Palamar onay, M. Fungal Keratitis and Corneal Perforation as a Rare Complication of Corneal Collagen Cross-Linking Treatment. OVID TECHNOLOGIES (WOLTERS KLUWER HEALTH), 2023, 42, -.
3. ünal, N.; Karaman, O.; Döğen, A.; Binzet, R. Investigation of the Chemical Composition, Antimicrobial, and Antioxidant Activity of Endemic Onosma halophila Boiss. & Heldr.. SPRINGER SCIENCE AND BUSINESS MEDIA LLC, 2023, 80, -.
2. özay, Y.; Alterkaoui, A.; Kahya, K.; özdemir, S.; Gonca, S.; Dizge, N.; Ocakoğlu, K.; Külekci, M. Antifouling and antibacterial performance evaluation of polyethersulfone membranes modified with AZ63 alloy. IWA PUBLISHING, 2023, 87, -.
1. Güzel kara, S.; öksüz, Z. Chemical Composition and Some Biological Activities of Vincetoxicum fuscatum subsp. fuscatum Seeds. SPRINGER SCIENCE AND BUSINESS MEDIA LLC, 2023, , -.